指細菌產生的毒素。可以區分為兩種：放到菌體外的稱為菌體外毒素（exotoxin）；含在體內的，在菌體破壞后而放出的，稱為菌體內毒素（endoto－xin）。但是在菌體外毒素中，也有通過菌體的破壞而放出體外的，所以這種區分法并不是很嚴密的。菌體外毒素大多是蛋白質，其中有的起著酶的作用。白喉桿菌、破傷風桿菌、肉毒桿菌等的毒素均為菌體外毒素。而菌體內毒素，其化學主體是來自細菌細胞壁的脂多糖和蛋白質的復合體，赤痢桿菌、霍亂弧菌及綠膿桿菌等的毒素都是這方面的例子。
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